Contoh konflik antar suku ini terjadi karena warga Madura dianggap gagal beradaptasi dengan orang Dayak yang menjadi tuan rumah. Akibatnya, ratusan orang dikabarkan meninggal dunia.
Kelompok Gerakan Aceh Merdeka (GAM) saat itu berkeinginan untuk memisahkan diri dari NKRI. Pemerintah yang tidak ingin melepaskannya begitu saja, mempertahankannya mati-matian sampai akhirnya terjadi peperangan di Tanah Rencong.
Contoh konflik antarsuku tersebut berakhir dengan kesepakatan yang disetujui oleh kedua belah pihak, yang menyepakati agar Aceh menjadi daerah otonomi khusus (otsus) dengan penegakan hukum syari'ahnya.
Apabila di bagian Barat ada Gerakan Aceh Merdeka, di bagian Timur juga ada kelompok Republik Maluku Selatan (RMS) dan Operasi Papua Merdeka (OPM) yang juga ingin lepas dari Republik Indonesia.
Meskipun belum tuntas, konflik dengan kedua kelompok separatis ini berhasil sedikit diredam oleh aparat TNI-Polri.