Selain itu, Transjakarta juga melakukan modifikasi waktu layanan pada 04.30-06.00 WIB. Seperti koridor 1 rute Blok M Kota yang dialihkan melalui koridor 9 dan 13 dengan melayani Halte Petojo, Kemanggisan, Petamburan, Gerbang Pemuda, Semanggi, Widya Chandra Telkomsel Denpasar, Simpang Kuningan, Pancoran, Tegal Mampang, Rawa Barat, dan Pasar Santa. Sentral sementara tidak melayani Halte Kebon Sirih sampai Halte Masjid Agung.
Lalu, tujuan Pulo Gadung - Monumen Nasional. Sementara arah Pulo Gadung akan melayani Halte Juanda dan Lapangan Banteng dan tidak melayani Halte Balai Kota, Gambir 2, Kwitang dan Monumen Nasional. Sedangkan untuk arah Monumen Nasional tidak melayani Halte Senen Raya, RSPAD, Pejambon, Istiqlal, dan Halte Monumen Nasional.
Sementara itu, pada pukul 05.00-06.00 WIB akan dilakukan modifikasi layanan koridor 1A rute Pantai Maju - Balai Kota. Rute ini tidak melayani Halte Balai Kota untuk kedua arah.
Koridor 5C Cililitan - Juanda, untuk arah Juanda tidak melayani Halte Kwitang dan Balai Kota, sedangkan untuk arah Cililitan menjadi melayani Halte Lapangan Banteng.
Koridor 7F Kampung Rambutan - Juanda via Cempaka Putih, untuk arah Juanda tidak melayani Halte Kwitang dan Balai Kota dan untuk arah Kampung Rambutan tidak melayani Halte Kwitang serta menjadi melayani Halte Lapangan Banteng.
Koridor 2A Pulogadung - Rawa Buaya via Balai Kota, untuk arah Rawa Buaya tidak melayani Halte Balai Kota dan arah Pulo Gadung tidak melayani Halte Balai Kota, Gambir 2, dan Kwitang. Serta menjadi melayani Halte Pecenongan, Juanda, dan Lapangan Banteng untuk kedua arah.