Setelah itu Wong menyelesaikan gelar Master di bidang Administrasi Publik dari Harvard Kennedy School.
Wong memulai karier sebagai ekonom di kementerian perdagangan. Dia pernah menduduki beberapa posisi penting dalam birokrasi Singapura, termasuk CEO Otoritas Pasar Energi serta jabatan bergengsi di kantor perdana menteri.
Karier Wong di dunia politik dimulai pada 2011 kemudian diangkat menjadi dewan direksi Otoritas Moneter Singapura, bank sentral. Dia juga memegang portofolio kebudayaan, pembangunan nasional, dan pendidikan.
Kareirnya semakin moncer saat pandemi Covid-19. Pada 2020, dia menjabat sebagai salah satu kepala gugus tugas penanganan Covid-19. Keputusan terbesar yang diambilnya adalah soal pembatasan perbatasan yang ketat kepada warga Singapura.
Setahun kemudian Wong diangkat menjadi menteri keuangan. Tahun berikutnya dia ditunjuk sebagai wakil perdana menteri dan penerus Lee.