Beberapa laporan media Barat dan Israel sebelumnya menyebut Mojtaba mengalami luka dalam serangan awal yang dilakukan Amerika Serikat dan Israel. Serangan tersebut dilaporkan terjadi pada Sabtu (28/2/2026). Dalam serangan itu, ayah Mojtaba Khamenei yakni Ali Khamenei disebut tewas bersama beberapa anggota keluarganya.
Spekulasi mengenai kondisi kesehatan Mojtaba juga muncul tidak lama setelah dia diangkat sebagai pemimpin tertinggi Iran. Saat itu, televisi pemerintah Iran menyebut Mojtaba sebagai veteran yang terluka dalam perang Ramadan. Sebagian analis menilai penggunaan istilah tersebut menjadi indikasi bahwa Mojtaba kemungkinan mengalami luka dalam serangan yang terjadi sebelumnya.
Hingga kini belum ada pernyataan resmi yang memastikan kondisi kesehatan Mojtaba Khamenei maupun keberadaannya saat ini.