Berikut jadwal penerbangan Citilink di 4 destinasi NTT, dari dan ke Kupang:
1. Kupang-Ende
Menggunakan pesawat penerbangan bernomor QG 1640 dengan jadwal penerbangan dari kupang 07.00 WITA dan tiba di Ende pukul 08.00 WITA.
Frekuensi penerbangan setiap hari.
2. Ende-Kupang menggunakan pesawat penerbangan bernomor QG 1641 dengan jadwal penerbangan dari Ende 08.25 WITA dan tiba di Kupa pukul 09.25 WITA. Frekuensi penerbangan setiap hari
3. Kupang-Labuan Bajo
Menggunakan pesawat penerbangan bernomor QG 1604 dengan jadwal penerbangan dari kupang 09:50 WITA dan tiba di Labuan Bajo pukul 11:05 WITA. Frekuensi penerbangan pada hari Rabu dan Jumat.
4. Labuan Bajo-Kupang
Menggunakan pesawat penerbangan bernomor QG 1605 dengan jadwal penerbangan dari Labuan Bajo 11.30 WITA dan tiba di Kupang pukul 12.40 WITA. Frekuensi penerbangan pada hari Rabu dan Jumat.
5. Kupang-Bajawa
Menggunakan pesawat bernomor penerbangan QG 1664 dengan jadwal penerbangan dari Kupang pukul 09.50 WITA dan tiba di Bajawa pukul 11.10 WITA. Frekuensi penerbangan setiap Senin, Selasa, Kamis, Sabtu, dan Minggu.